Binnen AEGEE bestaan er working groups. Dit zijn groepen die zich op Europees niveau bezig houden met een specifiek onderwerp. Hieronder staan alle working groups die op dit moment actief zijn. Ook staan alle working groups op een rij op de site van AEGEE www.aegee.org/wg
Academy
Deze working group richt zich vooral op de interne educatie binnen AEGEE. Ze hebben een eigen website: www.aegee-academy.org
Bobigosa
De bobigosa working group is een thematische 'denktank' waar mensen nadenken over de toekomst van AEGEE. Ook maken ze voorstellen voor veranderingen in het AEGEE-beleid. Ze zeggen nadrukkelijk dat ironie en sarcasme hun belangrijkste werktuigen zijn.
CWG (Cultural Working Group)
De CWG probeert kennis, respect en begrip te kweken over de vele culturen in Europa. Het wil vooral de culturele en artistieke diversiteit in Europa veiligstellen. Meer op hun site: www.aegee.org/wg/cwg
DWG (Dance Working Group)
In Europa bestaan vele traditionele dansen, de DWG is er van overtuigt dat kennis over deze dansen en het respecteren ervan belangrijk is voor een verenigd Europa. Zin in dansen, kijk op hun site: www.aegee.org/wg/dw
EWG (Education Working Group)
De Education Working Group is het verzamelpunt voor studenten die zich interesseren voor de Europese integratie op het gebied van het hoger onderwijs en graag willen bijdragen aan deze integratie. www.aegee.org/wg/ewg
HRWG (Human Rights Working Group)
Deze groep probeert onderwerpen over mensenrechten op de (AEGEE-)agenda te brengen en tevens hun bijdrage te leveren aan de verbetering van mensenrechten. www.aegee.org/wg/hrwg
IPWG (International Politics Working Group)
Deze working group probeert een Europees forum te zijn studenten die geïnteresseerd zijn in de internationale politiek. www.aegee.org/wg/ipwg
ITWG (Information Technologies Working Group)
De ITWG is een ondersteunende Working Group op allerlei zaken op IT gebied. Ze houden al het IT-gerelateerde binnen AEGEE draaiende. www.aegee.org/wg/itwg
VFF (Visa Freedom Fighters)
De Visa Freedom Fighters streven de vernietiging van visa's in Europa na. Ze proberen alle grenzen aan de mobiliteit van personen binnen Europa tegen te gaan. www.aegee.org/wg/vff